队伍一路南行，过武关，出商南，沿丹水而下。十一月时，抵达云梦。
云梦泽烟波浩渺，水天一色。始皇站在高处，望着这片广袤的水域，久久无言。远处，九疑山的轮廓若隐若现，那里葬着虞舜，那位传说中的圣君。
在距离九嶷山尚有一千五百里之遥时，秦始皇决定在云梦祭祀远古的帝王——虞舜。他在云梦设立祭台，面对南方的九嶷山举行祭祀仪式，祈愿国家安泰，万民安康。祭祀完成后，队伍继续东南行进，来到九江郡，秦始皇登上了庐山，欣赏那雄伟的山河景色。
此时，“陛下。”李斯走上前来，轻声道，“是否登船，渡江而行？”
始皇点点头。
船队沿着长江顺流而下，两岸的山川如画卷般展开。始皇站在船头，望着这片他亲手打下的江山，心中涌起复杂的情绪。
这片土地，太大了。
大到需要他用一生去征服，大到需要他用无数人的性命去填埋。可如今，他站在这片土地上，却感到一阵阵寒意从骨髓里渗出来。
那寒意，不是来自江风，而是来自身体深处。
他开始时不时的咳嗽了。
船队过丹阳，至钱唐。
钱唐是江南小县，城郭简陋，百姓稀疏。可始皇不是为这县城而来——他要渡浙江，登会稽，祭大禹。
然而，当他站在浙江岸边，望着眼前的景象时，眉头皱了起来。
江面宽阔如海，波涛汹涌，浪花拍打着岸边的礁石，发出雷鸣般的声响。风很大，吹得旌旗猎猎作响，吹得人几乎站不稳脚。
“水波恶。”李斯站在他身边，小心翼翼道，“陛下，这江面……怕是渡不得。”
始皇没有说话，只是望着那奔腾的江水。良久，他转身，淡淡道：“西行，从狭中渡。”
队伍西行一百二十里，终于找到一处江面狭窄的地方，勉强渡过。登上会稽山的那一刻，始皇长长地吐出一口气。
会稽山并不高，却有一种庄严的气息。山上有大禹陵，有禹王庙，还有无数关于那位治水圣君的传说。始皇登上山顶，望着远处的南海（今杭州湾），举行了庄重的祭拜仪式。祭祀后，始皇命人取来石碑，刻石记功。
李斯亲手书写碑文，一笔一划，都是小篆。碑文颂扬秦德，也训诫越人——“防隔内外，禁止淫泆，男女絜诚”“夫为寄豭，杀之无罪”。
刻石完毕，始皇站在碑前，久久未动。
他忽然想起二十年前，自己第一次东巡时，也是这样刻石记功，也是这样站在高处，望着这片土地。那时的他，意气风发，觉得自己可以征服一切。
可如今……
他低头看着自己的手，那双手已经开始微微颤抖。
离开会稽后，队伍北上，过吴县，从江乘渡江，沿着海岸线一路向北。
到了琅琊，始皇帝咳嗽还未好转，便派遣方士徐市入海求神药，很长时间花费良多也未求得神药。始皇感到不耐烦，突然想到东巡前扶苏（李承乾）给自己写的密信——若父皇身体不适，切不可轻信‘长生’‘丹药’之辞。思前想后，始皇便停了徐市等人求药之行。